Η οργανωτική δομή του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ. του Ελληνικού Μεσογειακού Πανεπιστημίου έχει ως εξής:
Α) Πρόεδρος του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.
Φώτιος Μαυροματάκης, Καθηγητής, Αντιπρύτανης Ακαδημαϊκών Θεμάτων και Δια Βίου Μάθησης
Β) Συμβούλιο του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.
Το Συμβούλιο αποτελείται από:
- Τον Πρόεδρο
- Έναν (1) εκπρόσωπο κάθε Σχολής του Ιδρύματος.
Το Συμβούλιο αποτελείται από τους εξής εκπροσώπους των Σχολών:
Σχολής Γεωπονικών Επιστημών
Τακτικό Μέλος: Εμμανουήλ Καμπουράκης, Αναπληρωτής Καθηγητής του Τμήματος Γεωπονίας
Αναπληρωματικό Μέλος: Κωνσταντίνος Πασχαλίδης, Αναπληρωτής Καθηγητής του Τμήματος Γεωπονίας
Σχολής Επιστημών Διοίκησης και Οικονομίας
Τακτικό Μέλος: Ευθαλία Ταμπουρατζή, Αναπληρώτρια Καθηγήτρια του Τμήματος Λογιστικής και Χρηματοοικονομικής
Αναπληρωματικό Μέλος: Μιχαήλ Ροβίθης, Αναπληρωτής Καθηγητής του Τμήματος Διοίκησης Επιχειρήσεων και Τουρισμού
Σχολής Επιστημών Υγείας
Τακτικό Μέλος: Γεώργιος Μαρκάκης, Καθηγητής του Τμήματος Κοινωνικής Εργασίας
Αναπληρωματικό Μέλος: Μιχαήλ Ζωγραφάκης – Σφακιανάκη, Αναπληρωτής Καθηγητής του Τμήματος Νοσηλευτικής.
Πολυτεχνική Σχολή
Τακτικό Μέλος: Νικόλαος Παπαδάκης, Επίκουρος Καθηγητής του Τμήματος Μηχανολόγων Μηχανικών
Αναπληρωματικό Μέλος: Νικόλαος Σπανουδάκης, Επίκουρος Καθηγητής του Τμήματος Ηλεκτρονικών Μηχανικών.
Σχολή Μουσικής και Οπτικοακουστικών Τεχνολογιών
Τακτικό Μέλος: Σπυρίδων Πολυχρονόπουλος, Επίκουρος Καθηγητής του Τμήματος Μουσικής Τεχνολογίας και Ακουστικής
Αναπληρωματικό Μέλος: Αικατερίνη Τζεδάκη, Αναπληρώτρια Καθηγήτρια του Τμήματος Μουσικής Τεχνολογίας και Ακουστικής
Γ) Διευθυντής Επιμόρφωσης του Κ.Ε.ΔΙ.ΒΙ.Μ.
Ιωάννης Κατσίγιαννης, Επίκουρος Καθηγητής του Τμήματος Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών
Δ) Γραμματεία
Καλλιόπη Κωνσταντάκη, ΠΕ Διοικητικού/Οικονομικού